內政部警政署為因應原水上警察局訓練海上執法人員之需要，責成本校於八十七年六月創設水上警察科，辦理水上警察人員養成教育，畢業後分發水上警察局，執行 海上執法、海事服務、海難救助與海洋資源維護等任務。

    八十九年二月中旬，水上警察局改隸行政院海岸巡防署，更名為海洋巡防總局。

   一零七年四月廿八日，更名為海洋委員會海巡署艦隊分署。

    鑑於水上警察養成教育由警大、警專辦理的優良傳統及卓越成效，海洋巡防總局經審慎評估並與內政部協商，關於海洋巡防人員的教育訓練，仍委託本校 辦理，本科因之改名為海洋巡防科。

    海巡警察必須兼具航海輪機、海域執法執勤、海洋資源維護、海事服務與海難救助等能力與技術，目前，國內並無任何學校能同時提供此等技能之養成與訓練。此外，海巡警察之培育，係依據海洋巡防總局人力需求與規劃而辦理，基於成本效益的考慮，海巡署亦無設立海巡專業學校之必要。

    據此，本科 係以平台的理念，建教合作的方式，受託辦理海巡警察養成教育。換言之，即以本校優良的隊職官制度、訓育輔導機制與充沛的法學師資為基礎，廣納相關領域大學的航海、輪機與海洋法師資，並善用海巡署的實務人才，群策群力辦理基層海巡警察養成教育。

航海、輪機技能之具備： 本科學生將分航海組與輪機組，諸如柴油機與輔機、輪機實務與安全、輪機當值、船用電學、自動控制、輪機工程學、熱力學、船舶構造與穩度及輪機管理等，皆列入主要課題。此部份課程配置攸關本科畢業生能否取得航海特考輪機員考試資格，故課程學分數配當，需符合標準。又海洋巡防之航海、輪機課程、實習演練至為重要。本校規劃設立航海、機電教室供學生實習，並與海巡總局建立建教合作機制，且本科學生將利用寒暑假赴海巡總局學習操船、航海、輪機等實務。 
　

海事法規及執法依據之修習： 海洋巡防人員目前之主要任務與輔助任務所牽涉的法規，除一般基本法學如刑法、刑訴法、海洋巡防法規外，尚需修習專業的國際海洋法，海事法規、航海學概論、國際公法及海上污染等科目。並利用寒暑假實習海上執法勤務。 
　

海上執勤專業技能之訓練： 海上技能之訓練，主要著眼於巡防人員執勤之自身安全、海難之 搜索救助，及符合交通部訂定航海人員訓練之要求，因此海上 執勤訓練項目有：

• 專長訓練：
  航海四項專長訓練，求生、急救、滅火、操艇及 ＧＭＤＳＳ （全球海上遇險救難系 統）之訓練，目前由海洋巡防總局委託中國海專及相關海事訓練機構辦理。
  　
• 游泳訓練：
  使學生深諳水性，適應海上生活，維護自身安全，本項訓練以游泳課程及晨間訓練 為主，並以長距離 壹仟公尺 為訓練目標 ，畢業生必須取得水上救生員證。 
  　
• 潛水訓練：
  使其具有救難基本能力，有效排除海上機件故障（如船舶舷外機攪等故障）及海上 搜索、打撈非法槍械與毒品丟包。 
  　
• 救生訓練：
  訓練海洋災害之救護，海難船舶與人員之搜索、救助。

一般警察法規之修習： 包括刑法、刑事訴訟法、警察法規等警察基本法學科目。

工作內涵

    若分發到一般海巡隊巡防艇服務，每天平均勤務時間約十二小時，其中上班八小時，四小時超勤加班。上班時間大多是出海執行勤務。勤務內容為守艇、岸戒、值班、執勤員與海勤。出海時間約8-10小時。放假會預先勾選，並視隊務運作，由主管調整。總放假日與一般公務員一樣。例如，民國100年國訂假日120天，平均或事先分配於各月，若一月可放假11天，則於99年12月先行勾假。另公務員之慰勞假，視年資有7-30天，也是視個人需求先行告知勾選。 若分發至機動海巡隊大型艦服務，每出海3-5天，輪休3天。其餘大致與一般海巡隊一樣。詳參海岸巡防勤務實施要點與相關規定。